Вернувшись после храмовых сражений, герои Земли обнаруживают свои земли в огне: армия Шао Кана уже вовсю хозяйничает дома, не дав защитникам и минуты на отдых. Райдэн осознает, что обычным сопротивлением захватчиков не выбить, и идет на риск, соглашаясь на решающую схватку на территории Внешнего мира. Пока Джонни Кейдж и Соня пытаются отбивать атаки чудовищ на улицах городов, Лю Кан уходит в жесткие тренировки, пытаясь совладать с новой пугающей силой. Параллельно Скорпион, копаясь в тайнах своего происхождения, натыкается на след заговора, нити которого ведут к сущностям куда страшнее самого императора. Весь турнир быстро превращается в кровавую неразбериху, где о кодексе чести забывают, а бойцы пачками гибнут в лесных засадах и на аренах.
Вскоре вскрывается, что амбиции Шао Кана — лишь ширма для глобального плана по воскрешению Единого Существа. Шиннок и Кван Чи втайне от всех собирают магические реликвии, манипулируя участниками ради своего темного обряда. Силы добра оказываются разделены: Соня с Джаксом вступают в схватку с механизированными убийцами Лин Куэй, а Лю Кану приходится выпустить внутреннего дракона, чтобы хоть как-то противостоять древней угрозе. Под занавес реальность начинает трещать по швам, а божественные силы Райдэна стремительно угасают. Герои бросаются в бой, полагаясь лишь на чутье и волю, когда границы миров окончательно стираются. Последняя битва разворачивается в эпицентре магического шторма, где выжить и остановить конец света можно только ценой предельной жертвы.
